Se reglamentan sus funciones en 1863 y se crea en 1896, constituido por fondos documentales de los Poderes Ejecutivos, Judicial y Legislativo, además de archivos Judiciales y Municipales. Se ubica en el centro histórico de la capital ocupando la segunda planta del edificio del antiguo Palacio Nacional, hoy Palacio Nacional de la Cultura, edificio histórico de estilo neoclásico, adecuado sin alterar su estilo arquitectónico, para albergar las instituciones culturales nacionales.
Resguarda los fondos de las instituciones y colecciones privadas o archivos particulares como de colecciones especiales. El Archivo Nacional posee documentos originales que datan de 1848, resguardando aproximadamente 10 millones de documentos, agrupados en 16 fondos bibliográficos.